Công ty Vedan VN hoạt động trên nhiều lĩnh vực có phát sinh nước thải dễ gây ô nhiễm môi trường như: sản xuất bột ngọt, tinh bột, nước đường, xút (NaOH), axit... Tổng lượng nước thải ra sông Thị Vải hơn 4.000m3/ngày. Hiện đoạn sông tại Công ty Vedan VN trú là nơi ô nhiễm nhất trên sông Thị Vải.